Es heißt, dass Präsident Harry Truman 1947 die Bildung eines Geheimausschusses zur Untersuchung des Roswell-Vorfalls angeordnet habe. Dieses Komitee bestand aus 12 Personen, darunter weltbekannte Wissenschaftler, Generäle und Politiker. Die Gruppe kam zu dem Schluss, dass es sich bei dem Vorfall tatsächlich um ein außerirdisches Raumschiff handelte, das bei einer Bruchlandung alle Insassen tötete, typischerweise zwischen drei und vier.
Die Majestic 12, oder kurz MJ-12, schlug eine Anordnung vor, eine militärische Einrichtung zu errichten, die ausschließlich der Eindämmung und Erforschung der Außerirdischen und ihrer Raumschiffe dient, woraus die Area 51 entstand.
Zahlreiche Bilder von Regierungskorrespondenz, die sich direkt auf diese Organisation beziehen, kursieren im Internet, darunter der berühmte Brief von Präsident Truman aus dem Jahr 1947, in dem er die CIA zur Entwicklung von M-12 ermächtigte. Der Brief ist nach Ansicht von Zweiflern völlig gefälscht.
Diese Theorie wird überwiegend durch solche Dokumentationen gestützt, die seit 1978 möglicherweise allesamt erfunden sind oder gar nicht existieren. Ein Auszug:
„Die offizielle Politik der US-Regierung und die Ergebnisse des Projekts Aquarius werden immer noch als streng geheim eingestuft, ohne dass sie außerhalb von Kanälen verbreitet werden und der Zugang auf ‚MJ TWELVE‘ beschränkt ist.“
Der überzeugendste Beweis, der selbst von vielen Skeptikern für authentisch gehalten wird, ist jedoch ein Dokument, das derzeit im Nationalarchiv in Washington, D.C. aufbewahrt wird. Bei dem Dokument handelte es sich um ein Memo vom 14. Juli 1954 von Robert Cutler, dem Sonderassistenten von Präsident Eisenhower an General Nathan Twining. Es las:
„Memorandum für General Twining. Betreff: NSC/MJ-12 Special Studies Project. Der Präsident hat beschlossen, dass der MJ-12 SSP“
MJ-12 hat es unter anderem in die populäre Science-Fiction-Kultur geschafft "Akte X," Normalerweise stellt man es sich als eine Diskussionsrunde mit zwölf Experten vor, in der es darum geht, was beim Beweis der Existenz von Außerirdischen zu tun ist und vor allem, wie die Öffentlichkeit im Dunkeln gehalten werden kann.
Zu den Personen, denen vorgeworfen wird, irgendwann Mitglieder von MJ-12 zu sein, gehören Albert Einstein, Robert Oppenheimer, Robert Cutler, Omond Solandt, Robert Sarbacher, John von Neumann (direkt am Philadelphia-Experiment beteiligt), Karl Compton und General Nathan Twining , und Eric Walker.