Det siges, at præsident Harry Truman i 1947 gav ordre til en hemmelig komité til at undersøge Roswell-hændelsen. Denne komité bestod af 12 personer, herunder verdenskendte videnskabsmænd, generaler og politikere. Gruppen kom til den konklusion, at hændelsen virkelig involverede et udenjordisk rumskib, der styrtede ned og dræbte alle dets ombordværende, typisk mellem tre og fire.
Majestic 12, eller kort sagt MJ-12, foreslog en bekendtgørelse om at etablere en militær facilitet udelukkende med det formål at indeslutte og studere rumskibet og deres rumskib, hvilket resulterede i område 51.
Masser af billeder af regeringskorrespondance, der er direkte relateret til denne organisation, cirkulerer på internettet, inklusive det berømte brev fra 1947 fra præsident Truman, der bemyndiger CIA til at oprette M-12. Brevet er ifølge tvivlere fuldstændig opdigtet.
Denne teori understøttes overvejende af sådan dokumentation, som alt sammen, der startede i 1978, måske er opdigtet eller måske slet ikke eksisterer. Et uddrag:
"Den officielle amerikanske regeringspolitik og resultaterne af Project Aquarius er [sic] stadig klassificeret TOP SECRET uden formidling uden for kanaler og med adgang begrænset til 'MJ TWELVE'."
Det mest overbevisende bevis, som selv af mange skeptikere menes at være autentisk, er et dokument, der i øjeblikket opbevares i National Archives i Washington, DC. til Gen. Nathan Twining. Der stod:
"Memorandum for General Twining. Emne: NSC/MJ-12 Special Studies Project. Præsidenten har besluttet, at MJ-12 SSP"
MJ-12 har gjort det til populær sci-fi kultur, bl.a "X-Files," og er normalt forestillet som en rundbordsdiskussion af tolv eksperter i, hvad man skal gøre vedrørende beviset for eksistensen af rumvæsner, primært hvordan man holder offentligheden i mørke.
Folk, der på et eller andet tidspunkt er anklaget for at være medlemmer af MJ-12, omfatter Albert Einstein, Robert Oppenheimer, Robert Cutler, Omond Solandt, Robert Sarbacher, John von Neumann (direkte involveret i Philadelphia-eksperimentet), Karl Compton, general Nathan Twining og Eric Walker.
