Diz-se que em 1947, o presidente Harry Truman deu ordem para um comitê secreto investigar o Incidente de Roswell. Este comitê consistia de 12 indivíduos, incluindo cientistas, generais e políticos de renome mundial. O grupo chegou à conclusão de que o Incidente realmente envolveu uma nave extraterrestre que caiu e matou todos os seus ocupantes, normalmente numerados entre três e quatro.
O Majestic 12, ou MJ-12 para abreviar, propôs uma ordem executiva para estabelecer uma instalação militar puramente com o propósito de conter e estudar o extraterrestre e sua nave espacial, resultando assim na Área 51.
Muitas imagens de correspondência do governo relacionadas diretamente a essa organização estão circulando na Internet, incluindo a famosa carta de 1947 do presidente Truman, autorizando a CIA a criar o M-12. A carta, de acordo com os céticos, é totalmente fabricada.
Esta teoria é predominantemente apoiada por tal documentação, a qual, a partir de 1978, pode ser fabricada ou até mesmo não existir. Um trecho:
“A política oficial do governo dos EUA e os resultados do Projeto Aquarius ainda são classificados como TOP SECRET sem divulgação fora dos canais e com acesso restrito a 'MJ TWELVE'.”
A evidência mais convincente, no entanto, acreditada até mesmo por muitos céticos como autêntica, é um documento atualmente guardado nos Arquivos Nacionais em Washington, DC. ao general Nathan Twining. Ele leu:
“Memorando para General Twining. Assunto: Projeto de Estudos Especiais NSC/MJ-12. O Presidente decidiu que o MJ-12 SSP”
MJ-12 tornou-se popular na cultura de ficção científica, incluindo "O arquivo x," e geralmente é imaginado como uma mesa redonda de doze especialistas sobre o que fazer em relação à prova da existência de extraterrestres, principalmente como manter o público no escuro.
Pessoas acusadas de serem membros do MJ-12, uma vez ou outra, incluem Albert Einstein, Robert Oppenheimer, Robert Cutler, Omond Solandt, Robert Sarbacher, John von Neumann (diretamente envolvido com o Experimento Filadélfia), Karl Compton, General Nathan Twining e Eric Walker.