On dit qu'en 1947, le président Harry Truman a donné l'ordre à un comité secret d'enquêter sur l'incident de Roswell. Ce comité était composé de 12 personnes, dont des scientifiques, des généraux et des politiciens de renommée mondiale. Le groupe est arrivé à la conclusion que l'incident impliquait vraiment un vaisseau spatial extraterrestre qui s'est écrasé et a tué tous ses occupants, généralement au nombre de trois à quatre.
Le Majestic 12, ou MJ-12 en abrégé, a proposé un décret exécutif pour établir une installation militaire uniquement dans le but de contenir et d'étudier les extraterrestres et leur vaisseau spatial, résultant ainsi de la zone 51.
De nombreuses images de correspondances gouvernementales directement liées à cette organisation circulent sur Internet, dont la fameuse lettre de 1947 du président Truman, autorisant la CIA à créer le M-12. La lettre, selon les sceptiques, est entièrement fabriquée.
Cette théorie est principalement étayée par une telle documentation, qui, à partir de 1978, peut être fabriquée ou même ne pas exister du tout. Un extrait :
"La politique officielle du gouvernement américain et les résultats du projet Aquarius sont [sic] toujours classés TOP SECRET sans diffusion en dehors des canaux et avec un accès limité à" MJ TWELVE "."
La preuve la plus convaincante, cependant, considérée même par de nombreux sceptiques comme authentique, est un document actuellement conservé aux Archives nationales à Washington, DC Le document était une note de service du 14 juillet 1954 de Robert Cutler, assistant spécial du président Eisenhower, adressée au général Nathan Twining. Il a lu:
«Mémorandum pour le général Twining. Objet : Projet d'études spéciales NSC/MJ-12. Le président a décidé que le MJ-12 SSP »
MJ-12 est devenu une culture de science-fiction populaire, notamment "Les X-Files", et est généralement imaginé comme une table ronde de douze experts sur ce qu'il faut faire concernant la preuve de l'existence d'extraterrestres, principalement comment garder le public dans l'ignorance.
Les personnes accusées d'être membres du MJ-12, à un moment ou à un autre, incluent Albert Einstein, Robert Oppenheimer, Robert Cutler, Omond Solandt, Robert Sarbacher, John von Neumann (directement impliqué dans l'expérience de Philadelphie), Karl Compton, le général Nathan Twining , et Eric Walker.