Atlit-Yam parece ser un asentamiento de una fase, que representa un breve período de ocupación antes de la invasión del mar que llevó al abandono de Atlit-Yam alrededor del 6300 a.
Frente a la costa de la aldea de Atlit se encuentra Atlit Yam, un asentamiento neolítico sumergido ubicado frente a la costa de Atlit en el actual Israel.
El sitio, que data entre el 6900 y el 6300 a. C., se encuentra aproximadamente a 10 metros bajo el nivel actual del mar y cubre un área de 40,000 metros cuadrados.
La inclinación tectónica y los cambios climáticos provocaron que los pantanos a lo largo de la llanura costera israelí se secaran al comienzo del Holoceno. La tierra recuperada a lo largo de la costa en retirada fue colonizada por pueblos neolíticos durante el Neolítico anterior a la alfarería (PPNB) y los períodos posteriores del Neolítico de alfarería, hasta que un aumento eustático en los niveles del mar sumergió los antiguos asentamientos a una profundidad de 8 a 12 metros debajo de la superficie. .
Atlit Yam se asentó alrededor del 6900 a. C., y los habitantes sobrevivieron con la subsistencia agrícola-pastoril-marina.
Los científicos creen que Atlit-Yam fue abandonada abruptamente como resultado de un tsunami que azotó la región, muy probablemente causado por una erupción volcánica en el área del Mediterráneo.
Los arqueólogos estaban particularmente interesados en el descubrimiento de dos esqueletos, uno de una mujer y otro de un niño, que revelaron los primeros casos conocidos de tuberculosis.