Sinasabing noong 1947, si Pangulong Harry Truman ay nagbigay ng utos para sa isang lihim na komite na mag-imbestiga sa Roswell Incident. Ang komiteng ito ay binubuo ng 12 indibidwal, kabilang ang kilalang-kilalang mga siyentipiko, heneral, at mga pulitiko. Ang grupo ay dumating sa konklusyon na ang Insidente ay talagang kinasasangkutan ng isang extraterrestrial spaceship na bumagsak at pumatay sa lahat ng mga sakay nito, na karaniwang may bilang sa pagitan ng tatlo at apat.
Ang Majestic 12, o MJ-12 sa madaling salita, ay nagmungkahi ng isang executive order na magtatag ng isang pasilidad ng militar para lamang sa layunin ng paglaman at pag-aaral ng extraterrestrial at ang kanilang spaceship, kaya nagresulta sa Area 51.
Maraming mga larawan ng mga sulat ng gobyerno na direktang nauugnay sa organisasyong ito ang nagpapakalat sa Internet, kabilang ang sikat na sulat noong 1947 mula kay Pangulong Truman, na nagpapahintulot sa CIA na lumikha ng M-12. Ang sulat, ayon sa mga nagdududa, ay ganap na gawa-gawa.
Ang teoryang ito ay higit na sinusuportahan ng naturang dokumentasyon, na lahat, na nagsimula noong 1978, ay maaaring gawa-gawa o maaaring wala man lang. Isang sipi:
“Ang opisyal na patakaran ng US Government at mga resulta ng Project Aquarius ay [sic] inuri pa rin ang TOP SECRET na walang dissemination sa labas ng mga channel at may access na limitado sa 'MJ TWELVE'."
Ang pinaka-nakakumbinsi na katibayan, gayunpaman, pinaniniwalaan kahit na ng maraming mga nag-aalinlangan na tunay, ay isang dokumento na kasalukuyang nakalagay sa National Archives sa Washington, DC Ang dokumento ay isang Hulyo 14, 1954, memo mula kay Robert Cutler, espesyal na katulong ni Pangulong Eisenhower, na tinutugunan kay Gen. Nathan Twining. Nabasa nito:
“Memorandum para sa General Twining. Paksa: NSC/MJ-12 Special Studies Project. Ang Pangulo ay nagpasya na ang MJ-12 SSP”
Ginawa ito ng MJ-12 sa tanyag na kultura ng sci-fi, kabilang ang "Ang X-Files," at karaniwang naiisip bilang isang round-table na talakayan ng labindalawang eksperto sa kung ano ang gagawin tungkol sa patunay ng pagkakaroon ng mga extraterrestrial, lalo na kung paano panatilihing madilim ang publiko.
Ang mga taong inakusahan bilang mga miyembro ng MJ-12, sa isang pagkakataon o iba pa, ay kinabibilangan nina Albert Einstein, Robert Oppenheimer, Robert Cutler, Omond Solandt, Robert Sarbacher, John von Neumann (direktang kasangkot sa Philadelphia Experiment), Karl Compton, General Nathan Twining , at Eric Walker.
